科学研究表明，作物种类之间对土壤养分的吸收量存在很大差异，单一作物的连年种植，可以造成一种作物对某些土壤养分的吸收压力加大，使土壤中某些养分呈现严重的亏缺状态，造成土壤养分失去平衡，从而使作物的产量和质量受到严重的影响。烟草连作同样可以造成土壤养分失衡，使土壤中缺乏某些营养元素。 连作对土壤微生物的影响 　　植物是土壤有机质的主要来源，因而也是土壤中绝大部分微生物直接和间接的主要营养来源。土壤微生物在分解有机物时，产生出植物生长所需的矿质养料。植物与微生物的相互关系是自然界元素的生物循环的核心。微生物和伸展在土壤中的植物根系发生直接接触，微生物多在根系附近发育或附着在根系的表面，微生物在土壤中的活动与植物的根系发育和营养吸收发生直接的关系。植物生长发育过程中的某些代谢产物，如糖类、酶、有机酸、氨基酸以及维生素和生长素类物质等，由根部分泌到土壤中，成为根系周围微生物的有效营养物质。各种植物根系分泌物的种类不同，分泌物的数量也有变化，这也对土壤根际微生物产生选择性影响。