神舟五号飞船已经实现了炎黄子孙千年飞天梦，神舟六号上天也许不再具有轰动效应，但神舟六号飞船载人毕竟与神舟五号飞船载人有着较大的区别，意义和风险程度均大不一样。 据有关航天专家透露，这次神舟六号载人飞行与2003年发射的神舟五号载人飞行最大不同之处就在于：一是航天员由一人变成了两人；二是由在轨运行一天变成了多天；三是两位航天员届时将打开返回舱与轨道舱连接处的舱门，首次进入轨道舱进行一些实验活动。 我国的神舟型号飞船返回舱是升空和返回时航天员乘坐的舱体，是根据满员承载三人而设计制造的，应该说承载两人绰绰有余。根据神舟六号载人飞船的运行特点，在飞船升空之前，有几个方面将有针对性地重点加强。如针对“两人”和“多天”，在对航天员进行培训时，必须加强两人之间的磨合和适应训练，如工作、生活习惯方面的协调以及脾气性格上的搭配等等。 神舟五号升空时最后选定由杨利伟担任首飞任务，而他的候补人选有2位。根据航天员选拔有关规定，选拔一人升空时，通过前期严格考核和挑选，飞行前的结果必须由一组三人组成的第一梯队，最后人选只能在这三人中产生。而现在是两人升空，那就必须由六人三组组成第一梯队，再加上选拔须有备份，届时就将由12个人组成六组梯队，进行强化训练，使得挑选余地更大。经过严格的选拔和考核，飞行前必须从第一梯队中的六人中最后确定两人，由这两位最优秀的航天员进入太空。