金鱼的种种颜色，主要是由于真皮层中许多有色素细胞所产生的。金鱼的颜色成分其实只有3种：黑、黄和兰。大多数色素细胞的色素位置是会变化的。家养金鱼鲜艳多变的体色，只不过是这3种成分的重新组合分布而已。所以金鱼的个体发育过程中，常有褪色现象，各种金鱼的幼鱼阶段几乎是差不多的灰褐色，由于色素细胞的部分消失而转变成成鱼的体色。黑色金鱼则因黑色色素细胞增加而形成黑色，在2-3年内会褪成橙红色。橙红色金鱼则常褪成白色。有些鱼则体表没有色素细胞，褪色后就成为透明鱼。而褪色过程的中间状态就形成了杂色金鱼。这其实就是很复杂的体色遗传的结果。